支原体、衣原体在人体细胞内，经历一个原体一始体一中间体一原体的生活周期。原体附于细胞表面，被细胞吞饮后，细胞变成空泡状，它在细胞内演变为始体（直径1μm，球型），当其以二分法繁殖分裂时，整个细胞被充满，这种分裂体叫中间体，最后细胞被破坏，释放出变小成熟的原体，进入新的细胞，开始新的生活周期。所以，支原体、衣原体的发病机理概括起来即：吸收、复制、附着和释放。它使细胞被损毁，愈后由瘢痕组织所代替。
